Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL049795.2-201ENST00000515055 667 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 IGHV3-37-201ENST00000518544 340 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC092171.5-201ENST00000608012 942 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AL805961.1-201ENST00000642026 753 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 APLP1-202ENST00000537454 2266 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 TMEM220-AS1-207ENST00000584714 541 ntTSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 WT1-AS_6.1-201ENST00000614919 121 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
POLR2AP24928 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms