Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SETD1B-201ENST00000267197 5772 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
POLR2CP19387 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms