Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 MEIKIN-205ENST00000616644 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 LINC02062-201ENST00000513175 478 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ASGR1-201ENST00000269299 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 HCG9-201ENST00000376800 663 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 RPS5-204ENST00000598098 536 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC025154.2-202ENST00000552379 592 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 IGLC1-201ENST00000390321 460 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 IGHV3OR15-7-201ENST00000558565 359 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ABCC9O60706 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.6 ms