Protein–RNA interactions for Protein: O14874

BCKDK, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, humanhuman

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDKO14874 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
BCKDKO14874 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MCL1-202ENST00000369026 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
BCKDKO14874 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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