Protein–RNA interactions for Protein: E9PCH4

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,651 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PCH4 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
E9PCH4 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 ANGPTL8-201ENST00000252453 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 CYB561A3-219ENST00000544118 1136 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
E9PCH4 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
E9PCH4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
E9PCH4 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
E9PCH4 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms