Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG63

ABCF2, ATP-binding cassette sub-family F member 2, humanhuman

Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF2Q9UG63 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ARHGEF7-214ENST00000478679 1833 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ABCF2Q9UG63 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms