Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVF7

FBXO28, F-box only protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO28Q9NVF7 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FBXO28Q9NVF7 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms