Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PARVAQ9NVD7 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PARVAQ9NVD7 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms