Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 BMS1P17-203ENST00000444357 552 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 BMS1P22-203ENST00000609679 552 ntTSL 4 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC19.81■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 BOLA3-201ENST00000295326 444 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PSME1-202ENST00000382708 1136 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC010745.3-201ENST00000439745 415 ntTSL 3 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RN7SL769P-201ENST00000469386 295 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 IMP3P2-201ENST00000489760 475 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 MSRB3-209ENST00000540804 884 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
ATG3Q9NT62 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms