Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TMEM143-203ENST00000435956 2272 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
HIRIP3Q9BW71 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms