Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV44

THUMPD3, THUMP domain-containing protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD3Q9BV44 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 YTHDF3-216ENST00000623280 5193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
THUMPD3Q9BV44 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.05■□□□□ -0
THUMPD3Q9BV44 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms