Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SEZ6L-203ENST00000360929 6307 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NRP2-204ENST00000360409 6662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IRAK3-201ENST00000261233 8663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LMX1B-202ENST00000373474 5797 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 IL17RD-201ENST00000296318 8720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TARDBP-201ENST00000240185 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CCDC97Q96F63 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms