Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP4Q8N3C7 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 OGFOD2-224ENST00000545612 1465 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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CLIP4Q8N3C7 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CLIP4Q8N3C7 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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