Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 SLC2A4-202ENST00000424875 1852 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CCDC83Q8IWF9 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.1 ms