Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC14.39□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
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USP43Q70EL4 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 HAL-202ENST00000538703 2637 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AL356585.2-201ENST00000625078 2396 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
USP43Q70EL4 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
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