Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 C14orf93-207ENST00000397382 1986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 MAGEA2-204ENST00000611674 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 CENPBD1P1-204ENST00000487264 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
GDF6Q6KF10 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
GDF6Q6KF10 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms