Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ALFQ53S48 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ALFQ53S48 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms