Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TMEM181-201ENST00000367090 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CHST5-201ENST00000336257 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 EIF4G1-201ENST00000342981 5667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 FXYD6-201ENST00000260282 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
SP6Q3SY56 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms