Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY17

SLC25A52, Solute carrier family 25 member 52, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A52Q3SY17 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TAPBPL-205ENST00000544021 772 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 LINC02356-202ENST00000552663 314 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
SLC25A52Q3SY17 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.9 ms