Protein–RNA interactions for Protein: Q2M3C7

SPHKAP, A-kinase anchor protein SPHKAP, humanhuman

Predictions only

Length 1,700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHKAPQ2M3C7 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MAATS1-203ENST00000463700 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL157392.3-216ENST00000437446 462 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CLEC11A-202ENST00000599973 1026 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 PCBP2-OT1-201ENST00000634357 590 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
SPHKAPQ2M3C7 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SPHKAPQ2M3C7 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
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