Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PKD2L2-205ENST00000508638 2333 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
IMPG1Q17R60 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 IL17RA-201ENST00000319363 8607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 VTN-201ENST00000226218 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TDRP-205ENST00000613071 3421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 PIK3CG-201ENST00000359195 5377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TCHH-201ENST00000368804 6900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 SYMPK-213ENST00000599460 5449 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
IMPG1Q17R60 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms