Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC016683.1-202ENST00000438409 583 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC011467.4-201ENST00000594891 528 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CKAP4-201ENST00000378026 3093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
NTRK3Q16288 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
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