Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC123786.1-201ENST00000581626 661 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
GRIK4Q16099 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
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