Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 AL355334.1-201ENST00000417713 215 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MRPS25-203ENST00000444840 1281 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC138649.2-201ENST00000615886 705 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
SKIV2LQ15477 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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