Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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RFTN1Q14699 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
RFTN1Q14699 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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