Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 COLEC11-201ENST00000236693 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PPP1CA-201ENST00000312989 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DNAJC17-212ENST00000627802 428 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC025048.1-201ENST00000592317 542 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MPZL2-202ENST00000438295 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TPRKB-202ENST00000318190 819 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 MIR7845-201ENST00000618396 99 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
CACNA1SQ13698 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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