Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
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ITGB3BPQ13352 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
ITGB3BPQ13352 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
ITGB3BPQ13352 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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