Protein–RNA interactions for Protein: Q10567

AP1B1, AP-1 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 949 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1B1Q10567 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 DUOX1-201ENST00000321429 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 PARD6G-201ENST00000353265 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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AP1B1Q10567 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
AP1B1Q10567 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
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