Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TMEM106C-201ENST00000256686 1394 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AL139289.2-201ENST00000424948 661 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNDQ07001 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms