Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
COPAP53621 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 PFDN4-201ENST00000371419 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 ARL6IP4-207ENST00000426960 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
COPAP53621 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
COPAP53621 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms