Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 DNAJB1P1-201ENST00000429417 1024 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC098934.1-204ENST00000430114 631 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC018755.3-203ENST00000597710 411 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AP001065.2-201ENST00000617205 644 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ERVK13-1-204ENST00000566343 567 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FOS-204ENST00000554617 796 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 GAD1-201ENST00000344257 1029 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC133961.1-201ENST00000503085 762 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 IKBKB-212ENST00000519735 1166 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC009264.1-206ENST00000592183 534 ntTSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MRPL19-201ENST00000358788 693 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMARCA4P51532 AC133919.1-201ENST00000562203 416 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms