Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MPRIPP1-201ENST00000452433 1089 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CCNB2-203ENST00000559622 1064 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LGALS3BP-202ENST00000585407 936 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC012506.3-201ENST00000415245 892 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 SPAG5-AS1-203ENST00000554154 491 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
FNTBP49356 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms