Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
KDELR1P24390 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms