Protein–RNA interactions for Protein: P11230

CHRNB1, Acetylcholine receptor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNB1P11230 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HNRNPA1P48-202ENST00000565308 961 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CHRNB1P11230 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms