Protein–RNA interactions for Protein: P07711

CTSL, Cathepsin L1, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSLP07711 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NFATC1-207ENST00000545796 3558 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AIPL1-204ENST00000570466 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ANAPC11-216ENST00000579133 563 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 FAM172A-206ENST00000509163 1369 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 LONRF3-203ENST00000422289 2898 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
CTSLP07711 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms