Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
E9PBE3 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
E9PBE3 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 RGS3-201ENST00000317613 2542 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 USP19-205ENST00000398898 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
E9PBE3 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
E9PBE3 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms