Protein–RNA interactions for Protein: A6NKT7

RGPD3, RanBP2-like and GRIP domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,758 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD3A6NKT7 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 NDUFB11-202ENST00000377811 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HIGD1A-203ENST00000430190 741 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL512306.1-201ENST00000432698 848 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 BX276092.5-201ENST00000439926 886 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AREG-202ENST00000502307 956 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC02176-201ENST00000569104 598 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL138720.1-201ENST00000629853 778 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SEPT12-201ENST00000268231 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 RPSAP15-201ENST00000448168 861 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC105390.1-201ENST00000511330 560 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LINC00431-202ENST00000636375 159 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC006158.1-201ENST00000610661 249 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CSAG3-203ENST00000638835 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 CSAG2-204ENST00000640702 793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RGPD3A6NKT7 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61 ms