Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMEM212-201ENST00000334567 1881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TACR2-201ENST00000373306 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CRCP-203ENST00000395326 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
SLC12A4Q9UP95 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms