Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E9

RRBP1, Ribosome-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRBP1Q9P2E9 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CNOT10-202ENST00000331889 2573 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
RRBP1Q9P2E9 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms