Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX63

BRIP1, Fanconi anemia group J protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRIP1Q9BX63 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ZNF385A-213ENST00000551771 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MFSD11-218ENST00000591864 446 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PPP1R32-205ENST00000538185 1107 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC009088.2-201ENST00000564743 463 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 TUBBP5-203ENST00000508529 1334 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
BRIP1Q9BX63 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.4 ms