Protein–RNA interactions for Protein: Q9BST9

RTKN, Rhotekin, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTKNQ9BST9 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC108142.1-201ENST00000505389 286 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RTKNQ9BST9 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms