Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 GPR53P-205ENST00000457298 1084 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TCTN1-202ENST00000397655 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RPS6KC1Q96S38 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RPS6KC1Q96S38 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.9 ms