Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 UBA5-213ENST00000494238 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC7Q96M83 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms