Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ZEB1-AS1-208ENST00000607166 2503 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
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GTF3C6Q969F1 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
GTF3C6Q969F1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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GTF3C6Q969F1 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
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