Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CSH2-203ENST00000392886 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC078991.1-201ENST00000437297 610 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PGAP2-208ENST00000464229 863 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MEF2C-AS2-201ENST00000510274 463 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CSH2-206ENST00000560142 749 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RNASEK-210ENST00000593646 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SELENOW-204ENST00000595615 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SELENOW-216ENST00000612212 875 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
EDAQ92838 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TUBA3D-201ENST00000321253 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ACYP1-201ENST00000238618 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NPPA-201ENST00000376476 728 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PMP22-206ENST00000494511 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GLIDR-205ENST00000640674 884 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC025271.4-201ENST00000621477 1726 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PNLDC1-202ENST00000392167 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 NR0B2-201ENST00000254227 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
EDAQ92838 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms