Protein–RNA interactions for Protein: Q92575

UBXN4, UBX domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN4Q92575 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PTPN5-204ENST00000396170 3871 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 BVES-201ENST00000314641 5567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZNF663P-201ENST00000400371 2722 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MARK3-205ENST00000429436 3371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CUEDC1-206ENST00000577830 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PAPOLA-201ENST00000216277 4519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 DDN-201ENST00000421952 3749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
UBXN4Q92575 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms