Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDP4

ZNF439, Zinc finger protein 439, humanhuman

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Length 499 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF439Q8NDP4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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ZNF439Q8NDP4 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ZNF439Q8NDP4 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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