Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ACAN-202ENST00000439576 8840 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LMNTD2Q8IXW0 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
LMNTD2Q8IXW0 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms