Protein–RNA interactions for Protein: Q6UX27

VSTM1, V-set and transmembrane domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSTM1Q6UX27 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 TGFA-205ENST00000444975 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 SLC1A4-205ENST00000531327 1217 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
VSTM1Q6UX27 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
VSTM1Q6UX27 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms