Protein–RNA interactions for Protein: Q68G74

LHX8, LIM/homeobox protein Lhx8, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX8Q68G74 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LINC02318-201ENST00000553785 1334 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LUZP4P1-201ENST00000415420 344 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GNGT1-202ENST00000428834 731 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC096736.3-201ENST00000510753 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 PTS-202ENST00000524931 696 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 PTS-204ENST00000525803 625 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC080011.1-201ENST00000552378 989 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 SLCO2B1-205ENST00000525650 2121 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 METTL6-201ENST00000383789 1413 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 EIF3FP3-201ENST00000434851 1086 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GRM7-AS3-208ENST00000455623 947 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
LHX8Q68G74 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95 ms